近日，福建农林年夜学教授朱方捷课题组与中国热带农业科学院研究员吕培涛课题组于《生物技术通报（英文）》（aBIOTECH）发表综述论文。文章总结了高通量判定顺式元件组的四类重要要领，先容了现有顺式元件数据库，切磋了园艺作物中已经判定的顺式调控元件怎样调控主要农艺性状，并瞻望了顺式调控元件于作物育种中的运用远景。
顺式元件组调控园艺作物多种农艺性状。aBIOTECH供图
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今朝，已经有超2000莳植物基因组获得解析，怎样解读、破译测序获得的基因组暗码，是后基因组时代的主要使命。不直接编码卵白质的基因组“暗物资”区域——非编码区中漫衍着年夜量可联合转录因子的功效位点，即顺式调控元件（Cis-regulatory elements, CREs）。
所有顺式元件形成顺式元件组（Cistrome），其与转录因子的互作，调控着基因的定时、定点、定量表达。是以，体系判定顺式元件组，不仅有助在解释非编码基因组功效片断、解析转录调控收集，同时也可为作物种质立异提供主要育种靶点。
判定顺式元件组的现有高通量要领重要基在如下四类原理：判定转录因子联合位点；判定相干表不雅遗传标志；基在序列活性的判定；基在基因组学的判定。
已经报导的研究中，顺式元件组与园艺作物的如下主要农艺性状相干：调控果实成熟、果实形态、果实色素代谢、非生物勒迫的相应，以和促成园艺作物革新。
文章指出，今朝高通量技术的兴起已经极年夜富厚了顺式调控元件相干的数据集，但同步立异、开发可解析顺式调控元件“语法”的数据分析要领也至关主要。最近几年来，人工智能与深度进金年金字招牌(jinnian)诚信至上-修的生长为研究、设计顺式调控元件提供了史无前例的机缘。未来的作物育种中，可经由历程精准设计、定向编纂相干顺式调控元件，来切确调治目标农艺性状，以开发具备更强天气顺应性和更高养分价值的园艺作物，孝敬在全世界农业的可连续生长。
吕培涛与朱方捷为该论文通信作者，福建农林年夜学未来技术学院博士生李甜及园艺学院讲师曾经雯为本文第一作者。研究获得了国家天然科学基金，国家重点研发计划，热带作物生物育种天下重点试验室项目，福建省雏鹰计划青年拔尖人材项目以和人社部高条理外洋人材项目的资助。
相干论文信息：https://doi.org/10.1007/s42994-025-00237-0
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